中醫學系教育目標：

傳承及發展傳統醫學，培養優秀的中、西醫師及醫藥研究人才，促進中醫藥現代化。

天然藥物碩士班教育目標：

配合傳統醫藥學的知識及經驗法則，以現代生物科技的科學研究方法，培育對天然藥物具專業知識的研發人才。

課程特色：

著重新知學習與實驗技術精練，課程設計涵蓋理論與實務課程，基礎課程與專業領域並重。

課程核心能力：

1、專業研究技能與能力（Professional skills and research abilities）

2、中醫藥知識（Background knowledge of chinese herbal medicine）

3、中草藥產業技術（Industrial techniques of herbal medicine）

4、科學研究倫理（Scientific ethics）

5、資訊整合與應用（Data organization and presentation）

6、終身學習能力（Lifelong learning）